「統計的有意性とP値に関するASA声明」
アメリカ統計学会が2016年に出した「p値」に関する声明文:
ASA Statement on Statistical Significance and P-values
http://amstat.tandfonline.com/doi/pdf/10.1080/00031305.2016.1154108 [pdf]
が翻訳され,「統計的有意性とP値に関するASA声明」[佐藤俊哉訳]として日本計量生物学会ウェブサイトで公開されました:
日本計量生物学会
http://biometrics.gr.jp/
統計的有意性とP値に関するASA声明
http://biometrics.gr.jp/news/all/ASA.pdf [pdf]
統計分析に少しでも関心のあるみなさんに.
「統計概念の可視化いろいろ」
R-psychologist による統計概念の可視化いろいろ.
- 「Understanding and Interpreting Correlations - an Interactive Visualization」※相関係数の可視化.相関係数を変化させたときの共通分散をオイラー図で示す.
- 「Interpreting Cohen's d effect size - an interactive visualization」※効果量(Cohen's d)の可視化.d の大小による確率密度関数の被覆度や検定に必要なサンプルサイズの変化を示す.
- 「Understanding Statistical Power and Significance Testing - an interactive visualization」※統計的検定の検出力,type-I error, type-II error, サンプルサイズ,効果量(Cohen's d)の関係の可視化.
- 「Interpreting Confidence Intervals - an interactive visualization」※信頼区間の可視化.
いずれも統計基礎概念の教育ツールとして役立つだろう.
〈統計学へのお誘い本リスト(19-November-2016版)〉
門前でまだ迷っている人のための誘惑本
- 結城浩/たなか鮎子[イラスト]『数学ガールの秘密ノート:やさしい統計』(2016年11月7日刊行,SB クリエイティブ,東京, x+301 pp., ISBN:9784797387124 → 版元ページ)※new※
- 高橋信『マンガでわかる統計学』(2004年7月刊行,オーム社,ISBN:4274065707→版元ページ)
入門する気になった人のための本
- 佐藤俊哉『宇宙怪人しまりす医療統計を学ぶ』(2005年12月刊行,岩波書店[岩波科学ライブラリー114],本体価格1,200円.ISBN:4000074547→版元ページ)
- 佐藤俊哉『宇宙怪人しまりす医療統計を学ぶ:検定の巻』(2012年6月刊行,岩波書店[岩波科学ライブラリー194],本体価格1,200円.ISBN:9784000295949→書評と目次)
- 三中信宏『みなか先生といっしょに 統計学の王国を歩いてみよう:情報の海と推論の山を越える翼をアナタに!』(2015年5月26日刊行,羊土社,東京,本体価格2,300円, ISBN:9784758120586 → 版元ページ)
- 粕谷英一『生物学を学ぶ人のための統計のはなし:きみにも出せる有意差』(1998年3月刊行,文一総合出版,ISBN:4829921234→書評と目次)
ヴィジュアル系の統計学入門書
- 市原清志『バイオサイエンスの統計学:正しく活用するための実践理論』(1990年2月刊行,南江堂,東京,本体価格4,660円,ISBN:9784524220366 → 版元ページ)
- 市原清志・佐藤正一『カラーイメージで学ぶ〈新版〉統計学の基礎[CD-ROM付]』(2014年9月刊行,日本教育研究センター,大阪,本体価格4,200円,ISBN:9784890261710 → 版元ページ)
Rを片手に統計修行とプログラミング勤行
- 奥村晴彦『Rで楽しむ統計』(2016年9月15日刊行,共立出版[Wonderful R・1], 東京, x+190 pp., 本体価格2,500円, ISBN:9784320112414 → 版元ページ)※new※
- Jared P. Lander[高柳慎一・牧山幸史・簑田高志訳|Tokyo.R 協力]『みんなのR:データ分析と統計解析の新しい教科書』(2015年6月22日刊行,マイナビ,東京,447 pp., 本体価格3,800円, ISBN:9784839955212 → 版元ページ)
- 石田基広『Rで学ぶデータ・プログラミング入門:RStudioを活用する』(2012年10月25日刊行,共立出版,東京,viii+278 pp., 本体価格3,200円,ISBN:9784320110298 → 版元ページ)
- 大森崇・阪田真己子・宿久洋『R Commander によるデータ解析・第2版』(2014年1月25日刊行,共立出版,東京,x+221 pp., 本体価格2,800円,ISBN:9784320110847 → 版元ページ)
- 竹村彰通『統計[第2版]』(2007年9月刊行, 共立出版[共立講座・21世紀の数学:第14巻], ISBN:9784320018518 → 目次|コンパニオン・サイト)
すでに入門してしまった人のための次なる本(線形モデルを中心に)
- Michael J. Crawley著[野間口謙太郎・菊池泰樹訳]『統計学:Rを用いた入門書 改訂第2版』(2016年4月刊行,共立出版,本体価格4,600円,ISBN:9784320111547 → 版元ページ)※new※
- 久保拓弥『データ解析のための統計モデリング入門:一般化線形モデル・階層ベイズモデル・MCMC』(2012年5月刊行,岩波書店[シリーズ:確率と情報の科学・第I期],東京,xiv+267 pp., 本体価格3,800円,ISBN:9784000069731 → 直販サイト|版元ページ|コンパニオンサイト)
- 粕谷英一『一般化線形モデル』(2012年7月刊行,共立出版[Rで学ぶデータサイエンス・10],東京,本体価格3,500円, ISBN:9784320110144 → 版元ページ)
- 鵜飼保雄『統計学への開かれた門』(2010年2月刊行,養賢堂,東京,本体価格4,200円,ISBN:9784842504636 → 版元ページ|コンパニオン・サイト)
- 三輪哲久『実験計画法と分散分析』(2015年9月25日刊行,朝倉書店[統計解析スタンダード],東京,viii+216 pp., 本体価格3,600円, ISBN:9784254128543 → 版元ページ)
ややイノチ懸け系な数理統計学書
- 中塚利直『応用のための確率論入門』(2010年6月18日刊行,岩波書店,東京,ISBN:9784000052061 → 版元ページ)
- 竹村彰通『現代数理統計学』(1991年12月刊行,創文社,ISBN:4423895080→版元ページ)
- 竹村彰通『多変量推測統計の基礎』(1991年9月刊行,共立出版,ISBN:4320014480→版元ページ)
- C・R・ラオ[奥野忠一・長田洋・篠崎信雄・広崎昭太・古河陽子・矢島敬二・鷲尾泰俊訳]『統計的推測とその応用』(1977年11月刊行,東京図書,ISBN:4489001746)
たまにはベイズもいかが?
- 伊庭幸人『ベイズ統計と統計物理』(2003年8月刊行,岩波書店[岩波講座〈物理の世界〉:物理と情報3],ISBN:4000111582 → 版元ページ)
- 間瀬茂『ベイズ法の基礎と応用:条件付き分布による統計モデリングとMCMC法を用いたデータ解析』(2016年2月10日刊行,日本評論社,東京, viii+262 pp., 本体価格3,500円, ISBN:9784535787858 → 版元ページ)
- 岩波データサイエンス刊行委員会(編)『岩波データサイエンス・Vol. 1:特集〈ベイズ推論とMCMCのフリーソフト〉』(2015年10月7日刊行,岩波書店[岩波データサイエンス(第I期)],東京, 144 pp., 本体価格1,389円, ISBN:9784000298513 → 版元ページ|コンパニオンサイト)※new※
- 松浦健太郎『StanとRでベイズ統計モデリング』(2016年10月25日刊行,共立出版[Wonderful R・2], 東京, xii+264 pp., 本体価格2,500円, ISBN:9784320112421 → 版元ページ)※new※
統計学の科学史と科学哲学,そしてこれから
- デイヴィッド・サルツブルグ[竹内惠行・熊谷悦生訳]『統計学を拓いた異才たち:経験則から科学へ進展した一世紀』(2010年4月1日刊行,日本経済新聞出版社[日経ビジネス人文庫1143],東京,504 pp.,税込価格1,200円,ISBN:9784532195397 → 版元ページ|書評)
- イアン・ハッキング著[広田 すみれ・森元良太訳]『確率の出現』(2013年12月28日刊行,慶應義塾大学出版会,東京,viii+394 pp., 本体価格3,800円,ISBN:9784766421033 → 版元ページ)
- エリオット・ソーバー著[松王政浩訳]『科学と証拠:統計の哲学入門』(2012年10月刊行,名古屋大学出版会,名古屋,本体価格4,600円,ISBN:9784815807122 → 版元ページ)
- シャロン・バーチュ・マグレイン[冨永星訳]『異端の統計学ベイズ』(2013年10月刊行,草思社, 本体価格2,400円,ISBN:9784794220011 → 版元ページ)
- 友永雅己・三浦麻子・針生悦子(編)『心理学の再現可能性:我々はどこから来たのか 我々は何者か 我々はどこへ行くのか』(2016年7月刊行,心理学評論刊行会[心理学評論・第59巻1号],京都, ISSN:0386-1058 → 版元ページ|公開サイト)※new※
なお余力がある人は統計科学の最前線へどうぞ!
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「Windows環境で「R」を導入するための絶対確実な方法(続)」
ちょうど二年前に書いた記事「Windows環境で「R」を導入するための絶対確実な方法」の続きとして:
長年にわたって方々でR実習の経験を積んできたおかげで,たいていのフシアワセには即座に対応できるようになったが,それでも新たなタイプのフシアワセに毎回遭遇するので,経験値はどんどん上がっていく.
Rにからむフシアワセのほとんどは,必要なRcmdr関連パッケージ群がちゃんとインストールされていないことが原因である.あるいは,古いRが残っていて,新しいパッケージとのバージョン不適合というケースもある.これらのフシアワセは最新バージョンのRに最新のパッケージ群をインストールすることをつねづね心がければ事前回避が可能だろう.
その一方で,必要なパッケージ群をzipから解凍できないという重篤なフシアワセは処置が大事になる.何度トライしても途中でzip解凍が中断されてしまうというケースに遭遇したときは,もうどうしようもないので,ちゃんと起動している別PCの「library」フォルダー(解凍済みの約10,000ファイル)を丸ごとコピペするという “生体肝移植” みたいなオペを施してやっと成功した.
Rがうまく動かないときの施術方針の基本はちまちまとした対症療法ではなく,Rとパッケージ群の丸ごと再インストールにかぎる(オフライン環境だとけっこうじゃまくさい作業になるが).それでダメなら “生体肝移植” という根治療法だ.ただし,ユーザー名がマルチバイト文字だとほぼ治療不能なので,別途PCを貸し出して対応するしかない.
シアワセのかたちはどれも同じに見えるが,フシアワセのかたちはそれぞれちがっている.
「/var/folders へのフォルダー移動(macOS Sierra)」
Sierra に変身してからずっと困っていたことのひとつは R パッケージ更新時のファイル格納場所に到達できなくなってしまったことだった.たとえば,パッケージ更新すると格納場所は
/var/folders/……/T//RtmpkMGJJt/downloaded_packages
//
」前までなら移動できると判明.つまり,第一段階として/var/folders/……/T
//
」以降のRtmpkMGJJt/downloaded_packages
//
」が “障害物” だったということ.ダイレクトには到達できず,“二段階移動” するしかないのは手間が増えてしまったな.[追記:7 November 2016]ダブルスラッシュ「//
」をシングルスラッシュ「/」に書き換えれば二段階を踏まなくてもフォルダー移動できることが判明した.つまり「/var/……//……
」→「/var/……/……
」とする.
「datasets-manual.pdf」
〈R日本語ドキュメントパッチ〉にある「datasets-manual.pdf」はR の組み込みデータのパッケージ datasets のマニュアルの日本語訳.ほかにもいろいろ.